寇克（威廉·夏特纳 饰）船长奉命最后一次指挥企业号宇宙飞船对抗外星人对地球的大规模攻击，他召集旧部和新队员执行任务，双方展开了一场殊死战斗。第一部的前半部几乎全是讲寇克船长召集旧部来执行任务，开场就是久违的企业号穿越太空，这个新式造型委实让当时的影迷惊艳不已。后半部的内容主要讲述寇克船长是如何成功地掌握舰队，并伙同战友们拯救银河系于生死存亡的。最后外星人心满意足地离开地球，继续它无尽的宇宙探险，而地球的危机也就此化解。